电子合同（EMS合同）的盖章方式主要包括以下几种：
数字证书是一种数字身份证明，用于证明电子签名和盖章人的身份。
通过数字证书盖章，可以确保合同在发送和接收过程中的真实性和完整性。
数字证书盖章在电子合同中被广泛使用，可以有效地防止伪造和篡改。
时间戳是在电子签名或盖章后添加的一段数字信息，它可以保证签署或盖章的时间和日期是真实的。
时间戳盖章通常会记录下签署或盖章的具体时间，并加盖在电子合同中。
通过第三方电子合同平台签署电子合同，可以直接在平台上进行盖章操作。
一般来说，第三方电子合同平台会提供可视化的盖章区域，用户只需将电子合同上传至平台，并在盖章区域进行操作即可。
纸质合同盖章方式
对于纸质合同，盖章方式通常包括：
在合同的落款处进行盖章，确保印章清晰、完整。
盖章后应检查加盖印章是否完整，避免漏盖或重叠。
将合同的多页在侧面错开，保证每一页都露出一小部分，面积大小要略大于印章的大小。
蘸取少量印油后将印章按压到错开的多页文件侧边上，印油干透后再次展开多页文件的侧边，检查是否有漏盖的页面，如有漏盖应当再次加盖。
法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
建议
选择合适的盖章方式：根据合同类型和实际需求选择最合适的盖章方式，如数字证书盖章适用于高安全要求的合同，第三方平台盖章适用于快速便捷的合同签署。
确保印章清晰：无论是电子合同还是纸质合同，盖章时应确保印章清晰、完整，避免模糊或重叠。
检查盖章效果：盖章后应仔细检查，确保每一页都盖有印章，且无漏盖或错盖现象。