日本留学签证更新需要准备以下材料：
1. 在留资格认定证明书
2. 两份留学理由书，说明在日本学习的大学与学科
3. 本人陈述书，描述个人情况
4. 誓约书，由日本大使馆签发，本人签名或盖章
5. 日本入境签证申请表，由日本驻华使馆签发
6. 亲属关系表，由日本驻华使馆签发
7. 出勤证明书，由事务室提供
8. 成绩证明书，由担当老师提供
9. 身元保证书，由保证人填写
10. 保证人在职证明书
11. 资产所得证明书，由保证人提供
12. 银行存折明细，展示保证人汇款用的账户信息
请注意，如果未交学杂费，可能无法获得“出席证明书”和“成绩证明书”。更新签证的过程通常比较简单，您需要在签证到期前一个月提交签证更新申请，并携带上述材料办理更新手续。