股权更改的处理流程主要包括以下几个步骤：
内部决策：公司应召开股东会或董事会，就股权变更事宜进行内部决策，确定转让方和受让方、转让价格、转让比例等关键信息，并形成书面决议。
签订股权转让协议：在内部决策达成一致后，转让方和受让方应签订股权转让协议，明确转让的标的、价格、支付方式、违约责任等条款，并由双方签字盖章。
提交申请材料：公司应向当地工商行政管理部门提交股权变更的书面申请，并附上公司变更登记申请书、股东会或董事会决议、股权转让协议、公司章程修正案、新旧股东的身份证明文件、公司营业执照副本复印件等材料。
审核与受理：工商行政管理部门在收到申请材料后，将对材料的完整性、合规性进行审核。如材料齐全且符合规定，工商行政管理部门将受理申请，并出具受理通知书。
发放新的营业执照：经审核通过后，工商行政管理部门将注销原股东的出资证明，并向公司发放新的营业执照，注明股权变更后的股东信息。
税务登记变更：公司应在股权变更完成后，及时向税务部门申请变更税务登记，提交税务登记变更申请书、股权转让协议、新营业执照副本复印件等材料。
缴纳税款：根据税法规定，股权转让可能涉及企业所得税、个人所得税等税种。公司应依法申报并缴纳相关税款，确保税务处理的合规性。
公司章程修正案：股权变更后，需要相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载，由全体股东签字、盖公章。
变更组织机构代码证：填写企业代码证变更表格，并提交相关材料至质量技术监督局办理。
变更税务登记证：拿着税务变更通知单到税务局办理。
变更银行信息：拿着银行变更通知单到基本户开户银行办理。
建议
确保合规性：在股权变更过程中，确保所有操作符合《中华人民共和国公司法》等相关法律法规的规定，避免法律风险。
详细记录：在内部决策和签订股权转让协议时，详细记录会议纪要和协议条款，以便后续查阅和验证。
及时沟通：在变更过程中，及时与工商行政管理部门、税务部门等相关机构沟通，确保变更流程顺利进行。
通过以上步骤，可以顺利完成股权变更，确保公司股权结构的合法性和有效性。