新疆主要信仰的宗教是 伊斯兰教，而伊斯兰教内部存在多个不同的派别。以下是新疆地区主要的伊斯兰教派别：
逊尼派是伊斯兰教的主要教派之一，全称“逊奈与大众派”，约占全世界穆斯林的85%以上。
新疆地区的绝大多数穆斯林属于逊尼派，他们遵行哈乃斐学派教法。
什叶派是伊斯兰教的另一主要教派，与逊尼派并称为不同的两大政治、宗教派别。
新疆地区有极少数穆斯林信仰什叶派，主要是塔吉克族。
依禅派是新疆地区的主要伊斯兰教派别之一，大约产生于公元16世纪后期。
它是由来自中亚地区的各种教团吸收了维吾尔等民族的文化传统，经过长期发展而形成的。
依禅派在新疆地区有广泛影响，其首领称为“依禅”，且职位世袭。
苏非主义是伊斯兰教的一个神秘主义派别，在中国新疆地区有广泛影响。
新疆地区的苏非主义派别包括白山宗（依禅卡朗派）和黑山宗（伊斯哈克·瓦里派）。
综上所述，新疆地区的伊斯兰教派别主要包括逊尼派、什叶派、依禅派和苏非主义派别。其中，逊尼派是主体教派，占绝大多数，而什叶派、依禅派和苏非主义派别则相对较少。